{"id":89,"date":"2012-06-04T11:30:42","date_gmt":"2012-06-04T10:30:42","guid":{"rendered":"http:\/\/blog-lecerveau.mcgill.ca\/?p=1626"},"modified":"2022-01-04T21:06:02","modified_gmt":"2022-01-04T20:06:02","slug":"cartographier-tous-les-circuits-du-cerveau-de-la-souris","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/2012\/06\/04\/cartographier-tous-les-circuits-du-cerveau-de-la-souris\/","title":{"rendered":"Cartographier tous les circuits du cerveau de la souris"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" class=\"alignleft size-full wp-image-1627\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/mba-project.jpg\" alt=\"\" width=\"110\" height=\"110\" \/><\/p>\n<p>Dans un article publi\u00e9 il y a pr\u00e8s de 20 ans dans la revue Nature, <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/i\/i_12\/i_12_cl\/i_12_cl_con\/i_12_cl_con.html#koch\"><span style=\"color: #008080;\">Francis Crick <\/span><\/a><\/span>et Ted Jones notaient qu\u2019apr\u00e8s un si\u00e8cle d\u2019\u00e9tude des voies nerveuses dans le cerveau humain, on connaissait encore tr\u00e8s peu de choses de leur architecture. Et ils ajoutaient que notre compr\u00e9hension du fonctionnement du cerveau (ou de ses rat\u00e9s) ne d\u00e9passerait jamais ses balbutiements actuels tant que nous n\u2019aurons pas une cartographie compl\u00e8te de ses circuits.<\/p>\n<p>Les neurobiologistes du Cold Spring Harbor Laboratory, aux \u00c9tats-Unis, viennent de franchir un pas important dans cette direction en rendant publics les premiers 500 t\u00e9rabits de donn\u00e9es associ\u00e9s \u00e0 leur projet de cartographie de l\u2019ensemble des voies nerveuses du cerveau de souris. Un projet ambitieux rendu possible par les bas co\u00fbts et les grandes capacit\u00e9s de stockage des ordinateurs d\u2019aujourd\u2019hui. Et simplement impensable il y a une dizaine d\u2019ann\u00e9es \u00e0 peine.<!--more--><\/p>\n<p>Quelles sont ces donn\u00e9es si nombreuses ? Essentiellement des images (de pr\u00e8s d\u2019un milliard de pixels chacune) de fines tranches de 20 microns d\u2019\u00e9paisseur du cerveau de la souris (ce qui donne environ 500 images par cerveau). La d\u00e9finition de ces images (disponibles sur le site du \u201cMouse Brain Architecture Project\u201d, le deuxi\u00e8me lien ci-bas) est telle qu\u2019on peut zoomer \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur jusqu\u2019au niveau des <span style=\"color: #ff0000;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/a\/a_01\/a_01_cl\/a_01_cl_ana\/a_01_cl_ana.html\"><span style=\"color: #ff0000;\">neurones et de leurs prolongements <\/span><\/a><\/span>qui forment les voies nerveuses.<\/p>\n<p>En parcourant les tranches adjacentes de ce \u00ab\u00a0microscope virtuel\u00a0\u00bb, on peut donc reconstituer le parcours des axones des neurones ayant re\u00e7u le colorant. Ces substances colorantes sont des virus att\u00e9nu\u00e9s ainsi que des substances couramment utilis\u00e9es pour <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/capsules\/outil_bleu03.html\"><span style=\"color: #008080;\">l&rsquo;identification des voies nerveuses<\/span><\/a><\/span>, ce qui permet de confirmer r\u00e9ciproquement les trac\u00e9s obtenus. Ce qui distingue cette entreprise toutefois, c\u2019est le caract\u00e8re syst\u00e9matique des points d\u2019injection des colorants, c\u2019est-\u00e0-dire une grille de points \u00e9galement r\u00e9partis sur l\u2019ensemble du cerveau de la souris.<\/p>\n<p>Et surtout, l\u2019\u00e9chelle \u00e0 laquelle cette cartographie est appliqu\u00e9e, l\u2019\u00e9chelle \u00ab\u00a0m\u00e9soscopique\u00a0\u00bb, telle que l\u2019avait d\u00e9j\u00e0 pr\u00e9sent\u00e9 Partha P. Mitra, le directeur du projet, dans un article scientifique publi\u00e9 en 2009. Il s\u2019agit d\u2019une \u00e9chelle plus fine que celle que l\u2019on peut obtenir avec <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/capsules\/outil_bleu13.htm\"><span style=\"color: #008080;\">l\u2019imagerie c\u00e9r\u00e9brale<\/span><\/a><\/span>, mais allant moins dans le d\u00e9tail que la microscopie \u00e9lectronique, capable de montrer le d\u00e9tail des synapses, mais applicable sur des cerveaux entiers que pour de tr\u00e8s petits cerveaux, comme celui de la mouche \u00e0 fruits.<\/p>\n<p>Ces scientifiques sont convaincus que c\u2019est \u00e0 cette \u00e9chelle qu\u2019ils pourront \u00e9tablir une carte des voies nerveuses qui sera essentiellement la m\u00eame pour diff\u00e9rents individus, parce que probablement d\u00e9termin\u00e9e g\u00e9n\u00e9tiquement pour une esp\u00e8ce donn\u00e9e. Le projet pilot\u00e9 par le Dr Mitra est d\u2019ailleurs inspir\u00e9 par le <span style=\"color: #ff9900;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2011\/02\/14\/liens-sur-la-fonction-des-niveaux-d%e2%80%99organisation\/\"><span style=\"color: #ff9900;\"><span style=\"color: #008080;\">Allen Brain Atlas<\/span><\/span><\/a><\/span>, un effort de cartographie de l\u2019expression des g\u00e8nes dans le cerveau de la souris.<\/p>\n<p>Signalons enfin que les donn\u00e9es du Mouse Brain Architecture Project publi\u00e9es le 1er juin dernier seront suivies par d\u2019autres qui viendront s\u2019ajouter chaque mois. Tout cela dans l\u2019esprit de plus en plus r\u00e9pandu de \u201cl\u2019open science\u201d d\u00e9j\u00e0 populaire en astronomie ou encore, au niveau de la vulgarisation scientifique, avec la philosophie du <span style=\"color: #ff9900;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/pop\/pop_copy\/pop_copy_d.html\"><span style=\"color: #ff9900;\">Copyleft <\/span><\/a><\/span>comme celle du Cerveau \u00e0 tous les niveaux !<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/neurosciencenews.com\/whole-brain-circuit-mapping-project-open-science\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> Neuroscientists Reach Major Milestone in Whole-Brain Circuit Mapping Project<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/brainarchitecture.org\/mouse\/about\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/a_lien.gif\" alt=\"a_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> <span style=\"color: #ff0000;\">The Mouse Brain Architecture Project<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Dans un article publi\u00e9 il y a pr\u00e8s de 20 ans dans la revue Nature, Francis Crick et Ted Jones notaient qu\u2019apr\u00e8s un si\u00e8cle d\u2019\u00e9tude des voies nerveuses dans le cerveau humain, on connaissait encore tr\u00e8s peu de choses de leur architecture. 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