{"id":517,"date":"2013-06-10T21:28:00","date_gmt":"2013-06-10T20:28:00","guid":{"rendered":"http:\/\/www.blog-lecerveau.org\/?p=2694"},"modified":"2022-01-04T21:05:58","modified_gmt":"2022-01-04T20:05:58","slug":"aidez-a-cartographier-nos-connexions-neuronales","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/2013\/06\/10\/aidez-a-cartographier-nos-connexions-neuronales\/","title":{"rendered":"Aidez \u00e0 cartographier nos connexions neuronales"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" class=\"alignleft size-full wp-image-2695\" title=\"eyewire\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/eyewire.jpg\" alt=\"\" width=\"110\" height=\"110\" \/><\/p>\n<p>Savez-vous que vous pouvez contribuer en quelques clics de souris \u00e0 un projet qui donne le vertige\u00a0: d\u00e9couvrir la structure microscopique des neurones du cerveau humain dans le but d\u2019\u00e9tablir une carte de toutes les connections qu\u2019ils entretiennent entre eux? C\u2019est en tout cas ce que le projet \u00ab\u00a0EyeWire\u00a0\u00bb du laboratoire du Dr. Sebastian Seung propose sous forme de jeu ouvert au grand public.<!--more--><\/p>\n<p>\u00ab\u00a0EyeWire\u00a0\u00bb s\u2019inscrit dans la d\u00e9marche de \u00ab\u00a0crowdsourcing\u00a0\u00bb de plus en plus utilis\u00e9e en science. Elle consiste \u00e0 mettre \u00e0 contribution les capacit\u00e9s cognitives de chacun d\u2019entre nous pour aider \u00e0 r\u00e9soudre des probl\u00e8mes pour lesquels il y a trop de donn\u00e9es \u00e0 analyser ou dont l&rsquo;analyse est simplement trop difficile pour des machines. C\u2019est le cas par exemple en astronomie o\u00f9 l\u2019on demande aux gens d\u2019aider \u00e0 identifier les amas d\u2019\u00e9toiles dans les photos \u00e0 haute r\u00e9solution prises par le t\u00e9lescope Hubble de la galaxie Androm\u00e8de (dernier lien ci-bas). Ou encore, en biologie, du projet \u00ab\u00a0Foldit\u00a0\u00bb qui permet sous forme de jeu lui aussi, d\u2019aider \u00e0 r\u00e9soudre le repliement complexe d\u2019une prot\u00e9ine sur elle-m\u00eame qui lui donne sa fonction particuli\u00e8re (avant dernier lien ci-bas).<\/p>\n<p>Mais ce qui rend le projet \u00ab\u00a0EyeWire\u00a0\u00bb particuli\u00e8rement excitant, c\u2019est qu\u2019en y collaborant, on peut avoir l\u2019impression de participer \u00e0 ce qu\u2019on fait un peu tous les jours\u00a0: essayer de mieux se comprendre. Sauf qu\u2019on le fait ici \u00e0 une \u00e9chelle qui nous est autrement inaccessible, celle de la carte intime des connexions des neurones de notre cerveau, que certains appellent <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2012\/05\/28\/nous-sommes-tous-un-reseau-complexe\/ \"><span style=\"color: #008080;\">le \u00ab\u00a0connectome\u00a0\u00bb<\/span><\/a><\/span>.<\/p>\n<p>On a beau le r\u00e9p\u00e9ter, les <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2010\/11\/15\/moins-de-cellules-gliales-quon-le-pretend\/\"><span style=\"color: #008080;\">85 milliards (ou \u00e0 peu pr\u00e8s) de neurones <\/span><\/a><\/span>du cerveau humain qui peuvent chacun former des centaines de connexions avec leurs semblables est d\u2019une telle complexit\u00e9 qu\u2019on a m\u00eame de la difficult\u00e9 \u00e0 la concevoir. C\u2019est pour cette raison que \u00ab\u00a0EyeWire\u00a0\u00bb, que l\u2019on pourrait traduire par \u00ab\u00a0le c\u00e2blage de l\u2019\u0153il\u00a0\u00bb, se concentre uniquement sur un sous-groupe de <a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/a\/a_02\/a_02_cl\/a_02_cl_vis\/a_02_cl_vis.html\"><span style=\"color: #ff0000;\">cellules ganglionnaires de la r\u00e9tine<\/span><\/a> appel\u00e9es \u00ab\u00a0cellules J\u00a0\u00bb (la r\u00e9tine elle-m\u00eame \u00e9tant consid\u00e9r\u00e9e comme une \u00ab\u00a0excroissance\u00a0\u00bb du cerveau). Et m\u00eame avec ces cibles restreintes, le d\u00e9fi demeure de taille.<\/p>\n<p>En effet, le Dr. Seung et son \u00e9quipe doivent d&rsquo;abord faire de fines tranches de toute la r\u00e9tine. Puis ils doivent photographier chacune de ces tranches avec un microscope \u00e9lectronique pour saisir dans le d\u00e9tail l\u2019architecture d\u00e9licate des connections nerveuses, <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/i\/i_01\/i_01_m\/i_01_m_fon\/i_01_m_fon.html#2\"><span style=\"color: #008080;\">les synapses<\/span><\/a><\/span>. Il devient ensuite possible de suivre les prolongements d&rsquo;image en image et de reconstruire ainsi en trois dimensions les agencements complexes entre axones et \u00e9pines dendritiques. Or les logiciels de reconnaissance de formes ont encore beaucoup de difficult\u00e9 \u00e0 suivre d\u2019une tranche \u00e0 l\u2019autre le trajet des prolongements neuronaux (ils en coupent ou en fusionnent souvent plusieurs ensemble).<\/p>\n<p>Et c\u2019est l\u00e0 que le bon vieux discernement humain arrive \u00e0 la rescousse ! On n\u2019a qu\u2019\u00e0 penser aux \u00ab\u00a0captcha\u00a0\u00bb que l\u2019on vous demande d\u2019identifier correctement avant de soumettre un commentaire dans un blogue par exemple. T\u00e2che assez facile pour nous, mais pas pour les logiciels de spam. Et c\u2019est la m\u00eame chose pour d\u00e9cider si deux formes allong\u00e9es adjacentes sont le m\u00eame axone ou pas.<\/p>\n<p>Sauf que \u00e7a prend entre 15 et 80 heures \u00e0 quelqu\u2019un d\u2019entra\u00een\u00e9 pour reconstruire ainsi la structure tridimensionnelle d\u2019un seul neurone. \u00c0 ce rythme, on en aurait donc pour 570 000 000 ann\u00e9es pour cartographier le cerveau humain\u2026 D\u2019o\u00f9 l\u2019id\u00e9e de demander de l\u2019aide du grand public.<\/p>\n<p>Lanc\u00e9 \u00e0 la fin de l\u2019automne 2012, EyeWire a d\u00e9j\u00e0 attir\u00e9 pr\u00e8s de 60 000 \u00ab\u00a0joueurs\u00a0\u00bb de 150 pays diff\u00e9rents. Et un million de petits cubes de 4x4x4 microns ont d\u00e9j\u00e0 pu \u00eatre cartographi\u00e9s. Qui plus est, en identifiant les parties de neurones qui vont ensemble, les gens contribuent \u00e0 \u00ab\u00a0instruire\u00a0\u00bb un algorithme <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/i\/i_12\/i_12_p\/i_12_p_con\/i_12_p_con.html#3\"><span style=\"color: #008080;\">d\u2019intelligence artificielle<\/span><\/a><\/span> qui pourra ainsi apprendre \u00e0 r\u00e9duire ses erreurs et\u00a0\u00e9ventuellement permettre d\u2019automatiser davantage la cartographie. Car il est clair qu\u2019au XXIe si\u00e8cle le facteur limitant, en neuroscience comme dans bien d\u2019autres disciplines, n\u2019est plus tant l\u2019acquisition de donn\u00e9es que leur traitement.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.blog.eyewire.org\/about\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> About EyeWire<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"https:\/\/www.blog.eyewire.org\/play-eyewire-and-contribute-to-neuroscience-research-at-mit\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> Play EyeWire and Contribute to Neuroscience Research at MIT<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.youtube.com\/watch?feature=player_embedded&amp;v=hpSA3_ZFWB0\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> EyeWire Demo<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/eyewire.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> EyeWire<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.nature.com\/spoton\/2013\/03\/spoton-nyc-communication-and-the-brain-a-game-to-map-the-brain\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> A Game To Map The Brain<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.youtube.com\/watch?v=HarpGSmvPns&amp;feature=youtu.be\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> Neuron Synapse Zoom<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/fold.it\/portal\/info\/about\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> The Science Behind Foldit<\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.washington.edu\/news\/2012\/12\/04\/crowdsourcing-the-cosmos-astronomers-welcome-all-to-identify-star-clusters-in-andromeda-galaxy\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> Crowdsourcing the cosmos: Astronomers welcome all to identify star clusters in Andromeda galaxy<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Savez-vous que vous pouvez contribuer en quelques clics de souris \u00e0 un projet qui donne le vertige\u00a0: d\u00e9couvrir la structure microscopique des neurones du cerveau humain dans le but d\u2019\u00e9tablir une carte de toutes les connections qu\u2019ils entretiennent entre eux? 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