{"id":2845,"date":"2024-05-13T14:19:14","date_gmt":"2024-05-13T13:19:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/?p=11573"},"modified":"2024-05-21T14:35:32","modified_gmt":"2024-05-21T13:35:32","slug":"11573","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/2024\/05\/13\/11573\/","title":{"rendered":"Quand des reconstitutions spectaculaires des neurones du cortex humain s’invitent \u00e0 la fin d’un projet de livre"},"content":{"rendered":"

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Le probl\u00e8me avec la recherche scientifique, c\u2019est que \u00e7a n\u2019arr\u00eate jamais. \u00c0 plus forte raison quand on fait le pari un peu fou de pr\u00e9senter dans un livre l\u2019\u00e9tat d\u2019un vaste domaine de recherche comme les sciences cognitives et son histoire depuis un si\u00e8cle<\/a><\/span> ! Et donc il peut arriver que tu te retrouves \u00e0 la toute fin du projet, en train de peaufiner la mise en page, et qu\u2019un ami qui suit de pr\u00e8s les publications neuroscientifiques dans les grands journaux (merci Jean-Pierre) te signale une publication majeure dans Science<\/a><\/span><\/strong> sur la reconstitution, \u00e0 partir d\u2019image en microscopie \u00e9lectronique, de neurones du cortex humain avec une pr\u00e9cision in\u00e9gal\u00e9e. Et comme tu te rends compte que c’est l\u2019\u00e9quipe de Jeff Lichtman \u00e0 Harvard qui est derri\u00e8re ces travaux et que tu en as d\u00e9j\u00e0 parl\u00e9 dans ton blogue il y a dix ans<\/a><\/span>, tu te dis, de un, que tu dois en faire un autre billet parce que les images des neurones qu\u2019ils r\u00e9ussissent \u00e0 produire sont rendues trop spectaculaires (l’image ci-haut repr\u00e9sente par exemple un neurone avec 5 600 axones (bleus) qui y font des connexions (en vert)); et de deux, que ce serait formidable d\u2019essayer d\u2019en inclure dans ton livre, au grand dam de ton \u00e9diteur qui cherche plut\u00f4t \u00e0 r\u00e9duire la taille d\u2019un bouquin en question d\u00e9j\u00e0 assez costaud merci<\/a><\/span> !<\/p>\n

On verra bien pour le deuxi\u00e8me point, mais pour le premier (et pour me laisser du temps pour n\u00e9gocier le second aujourd\u2019hui\u2026), je me contenterai de traduire les deux petits paragraphes de pr\u00e9sentation de leur travaux en vous mettant quelques-unes de ces splendides images qui donnent presque le vertige en pensant que ce sont des milliards de ces petites sculptures d\u2019une pr\u00e9cision incroyables<\/a><\/span><\/strong> qu\u2019abrite notre bo\u00eete cr\u00e2nienne…<\/p>\n

\u00ab\u00a0Le laboratoire Lichtman de l’universit\u00e9 de Harvard et l’\u00e9quipe Connectomics at Google publient l’ensemble de donn\u00e9es \u00ab\u00a0H01\u00a0\u00bb qui sont un volume de 1,4 p\u00e9taoctet d’un petit \u00e9chantillon de tissu c\u00e9r\u00e9bral humain. L’\u00e9chantillon a \u00e9t\u00e9 imag\u00e9 \u00e0 une r\u00e9solution nanom\u00e9trique par microscopie \u00e9lectronique \u00e0 section s\u00e9rielle, reconstruit et annot\u00e9 par des techniques informatiques automatis\u00e9es, et analys\u00e9 pour obtenir des informations pr\u00e9liminaires sur la structure du cortex humain.<\/p>\n

L’ensemble de donn\u00e9es comprend environ un millim\u00e8tre cube de donn\u00e9es d’imagerie, y compris des dizaines de milliers de neurones reconstruits, des millions de fragments de neurones, 183 millions de synapses annot\u00e9es, 100 cellules corrig\u00e9es par des humains (les logiciels d\u2019IA faisant parfois des erreurs de reconnaissance de structures), et de nombreuses annotations et structures subcellulaires suppl\u00e9mentaires – le tout facilement accessible avec l’interface de navigation Neuroglancer<\/a><\/span><\/strong>.\u00a0\u00bb<\/p><\/blockquote>\n

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Synapses excitatrices (en jaune) et inhibitrices (en bleu) repr\u00e9sent\u00e9es comme des points sur le neurone qui re\u00e7oit ces connexions.<\/p>\n

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Rendu bas\u00e9 sur des donn\u00e9es de microscopie \u00e9lectronique, montrant les positions des neurones dans un fragment du cortex c\u00e9r\u00e9bral. Les neurones sont color\u00e9s en fonction de leur taille.<\/p>\n

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