{"id":2678,"date":"2023-01-16T16:46:40","date_gmt":"2023-01-16T15:46:40","guid":{"rendered":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/?p=10792"},"modified":"2023-01-23T17:42:54","modified_gmt":"2023-01-23T16:42:54","slug":"10792","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/2023\/01\/16\/10792\/","title":{"rendered":"Journal de bord de notre cerveau \u00e0 tous les niveaux : la relation circulaire entre les g\u00e8nes et le m\u00e9tabolisme"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/Encadre-chapitre-2.jpg\"><img loading=\"lazy\" class=\"alignnone size-full wp-image-10800\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/Encadre-chapitre-2.jpg\" alt=\"\" width=\"597\" height=\"380\" \/><\/a><\/p>\n<p>Comme je l\u2019\u00e9voquais dans <span style=\"color: #008080;\"><a style=\"color: #008080;\" href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2023\/01\/09\/10779\/\">mon billet de la semaine derni\u00e8re<\/a><\/span>, je compte alimenter encore dans les mois qui viennent mon \u00ab journal de bord \u00bb de l\u2019\u00e9criture de mon livre qui entre dans sa phase de relecture finale. Et l\u2019une des choses qu\u2019on savait d\u00e9j\u00e0 depuis longtemps mais que j\u2019ai d\u00fb m\u2019avouer officiellement r\u00e9cemment, c\u2019est que c\u2019est beaucoup trop long ! Je ne vous dirai pas le nombre de page qu\u2019il fait actuellement de peur de vous effrayer, et n&rsquo;\u00e9voquerai que vaguement les plusieurs centaines de pages de notes avec lesquelles je commen\u00e7ais \u00e0 \u00e9crire chaque chapitre (et il y en a 12, plus prologue et \u00e9pilogue\u2026), mais il eut tout un travail de synth\u00e8se \u00e0 faire pour arriver \u00e0 la version actuelle qui est, donc, encore trop longue. Que faire alors ? Enlever des phrases pas essentielles ici et l\u00e0 ? \u00c0 ce rythme, je n\u2019y arriverai jamais\u2026 Il me fallait enlever carr\u00e9ment quelques \u00ab gros morceaux \u00bb par chapitre pour esp\u00e9rer voir le nombre de page diminuer substantiellement, la force d\u2019un bras humain pour tenir un livre ayant ses limites\u2026 Chaque chapitre comportant plusieurs encadr\u00e9s venant donner certains compl\u00e9ments d\u2019information, on a donc d\u00e9cid\u00e9 d\u2019en retirer certains et de les transformer en\u2026 billets de blogue !<!--more--><\/p>\n<p>Ce qu\u2019il faut savoir ici, c\u2019est que le livre va entretenir des rapports \u00e9troits entre le site web <em>Le cerveau \u00e0 tous les niveaux<\/em> et son blogue. \u00c0 de nombreux endroits dans le livre, des renvois \u00e0 certaines pages du site ou \u00e0 certains billets de blogue sont faits pour permettre d\u2019aller plus loin dans la compr\u00e9hension d\u2019un ph\u00e9nom\u00e8ne. \u00c7a permet d\u2019optimiser ce travail d\u00e9j\u00e0 fait, et d\u2019all\u00e9ger d\u00e9j\u00e0 un peu le livre. En transformant certains encadr\u00e9s du livre en billet de blogue et en indiquant \u00e0 l\u2019endroit pr\u00e9cis o\u00f9 se situait cet encadr\u00e9 dans le livre la r\u00e9f\u00e9rence pour en retrouver la trace sur le blogue, on ne fait donc qu\u2019\u00e9tendre un peu une m\u00e9thode d\u00e9j\u00e0 mise en place depuis le d\u00e9but du projet.<\/p>\n<p>Comme le livre adopte une approche du plus simple au plus complexe, ses chapitres ont tendance \u00e0 \u00eatre de plus en plus volumineux. Je n\u2019ai donc rien trouv\u00e9 \u00e0 enlever dans le prologue et le chapitre 1 d\u00e9j\u00e0 pas trop long, mais au chapitre deux, j\u2019ai fait une premi\u00e8re petite ponction, parfaite pour introduire ici doucement ce proc\u00e9d\u00e9. Pour situer le contexte un peu, <span style=\"color: #008080;\"><a style=\"color: #008080;\" href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2022\/03\/28\/journal-de-bord-de-notre-cerveau-a-tous-les-niveaux-de-la-poussiere-detoile-a-la-vie-ces-bizarreries-qui-font-quon-est-ici-aujourdhui\/\">le chapitre 2 parle de la longue \u00e9volution d\u2019abord cosmique, puis chimique, et finalement biologique qui a men\u00e9e jusqu\u2019\u00e0 nous<\/a><\/span>. J\u2019y parle donc de l\u2019apparition de la vie, et forc\u00e9ment d\u2019une de ses caract\u00e9ristiques essentielles, la reproduction. Cela m\u2019am\u00e8ne forc\u00e9ment \u00e0 parler un peu du support mol\u00e9culaire de la m\u00e9moire g\u00e9n\u00e9tique de chaque esp\u00e8ce qu\u2019est la mol\u00e9cule d\u2019acide d\u00e9soxyribonucl\u00e9ique, l\u2019ADN. Et c\u2019est l\u00e0 o\u00f9 arrivait \u00e0 un moment donn\u00e9 cet encadr\u00e9 sur une ancienne conception bien trop tr\u00e8s lin\u00e9aire des interactions entre l\u2019ADN et deux autres types de mol\u00e9cules essentielles \u00e0 la vie, l\u2019ARN et les prot\u00e9ines. Je vous laisse donc avec ce court encadr\u00e9 qui parle donc d\u2019un changement de conception important par rapport \u00e0 la fa\u00e7on dont on a longtemps pr\u00e9sent\u00e9 ces interactions.<\/p>\n<p style=\"text-align: center;\">* * *<\/p>\n<p>On est aujourd\u2019hui loin de la compr\u00e9hension lin\u00e9aire simpliste qu\u2019on avait du d\u00e9but de la g\u00e9n\u00e9tique o\u00f9 le \u00ab\u00a0programme g\u00e9n\u00e9tique\u00a0\u00bb de l\u2019ADN \u00e9tait copi\u00e9 en ARN messager qui, lui, sortait du noyau pour \u00eatre traduit en prot\u00e9ines dans le cytoplasme. Comme on vient de le voir, il s\u2019agit plut\u00f4t d\u2019un r\u00e9seau m\u00e9tabolique complexe o\u00f9 r\u00e8gne une logique circulaire qui n\u2019admet pas de \u00ab\u00a0programme\u00a0\u00bb, et donc de point de d\u00e9part absolu. Il faut donc se d\u00e9faire de cet h\u00e9ritage trop \u00ab\u00a0g\u00e9nocentriste\u00a0\u00bb o\u00f9 l\u2019ADN est \u00e0 la base de tout car il fournit les plans.<\/p>\n<p>Henri Atlan a \u00e9t\u00e9 l\u2019un des premiers \u00e0 le faire, au d\u00e9but des ann\u00e9es 1970, en attirant\u00a0 l\u2019attention sur le fait que <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/www.seuil.com\/ouvrage\/l-organisation-biologique-et-la-theorie-de-l-information-henri-atlan\/9782020833257\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u2019ADN ne peut pas \u00eatre analogue \u00e0 un plan ou \u00e0 un programme parce qu\u2019il s\u2019agit d\u2019un programme qui a besoin de ses produits<\/a><\/span><\/strong>. L\u2019ADN est seulement une mol\u00e9cule parmi tant d\u2019autres au sein d\u2019un immense r\u00e9seau, une mol\u00e9cule particuli\u00e8rement stable, c\u2019est vrai. Une mol\u00e9cule qui, en tant que macromol\u00e9cule complexe, est porteuse de beaucoup d\u2019information, c\u2019est vrai aussi. Mais cela ne lui donne pas pour autant ce statut sup\u00e9rieur de r\u00e9plicateur tout puissant que certains ont voulu lui donner, en particulier Richard Dawkins dans son livre <em>Le G\u00e8ne \u00e9go\u00efste<\/em>, publi\u00e9 en 1976. Plusieurs aspects de cette conception ont soulev\u00e9 <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Gene-centered_view_of_evolution#Criticisms\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">de nombreux d\u00e9bats et critiques<\/a><\/span> <span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/Le_G%C3%A8ne_%C3%A9go%C3%AFste#Mystique_de_l'ADN\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">ici<\/a><\/span><\/strong>, <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/aeon.co\/essays\/the-selfish-gene-is-a-great-meme-too-bad-it-s-so-wrong\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u00e0<\/a><\/span><\/strong>, <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC5804262\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u00e0<\/a><\/span><\/strong>, <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/ase.tufts.edu\/cogstud\/dennett\/papers\/shallwetango.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u00e0<\/a><\/span><\/strong>, <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/necsi.edu\/selfish-gene-theory-of-evolution-called-fatally-flawed\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u00e0<\/a><\/span><\/strong> ou <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/www.resilience.org\/stories\/2017-08-08\/the-dangerous-delusions-of-richard-dawkins\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">l\u00e0<\/a><\/span><\/strong>, ainsi que par le pal\u00e9ontologue Stephen Jay Gould,<strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/www.pbs.org\/wgbh\/nova\/article\/what-evo-devo\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> l\u2019approche \u00ab evo-devo \u00bb<\/a><\/span><\/strong> ou <strong><span style=\"color: #808080;\"><a style=\"color: #808080;\" href=\"https:\/\/carlzimmer.com\/the-meaning-of-life-437\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">la th\u00e9orie des syst\u00e8mes \u00e9volutifs<\/a><\/span><\/strong>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Comme je l\u2019\u00e9voquais dans mon billet de la semaine derni\u00e8re, je compte alimenter encore dans les mois qui viennent mon \u00ab journal de bord \u00bb de l\u2019\u00e9criture de mon livre qui entre dans sa phase de relecture finale. Et l\u2019une des choses qu\u2019on savait d\u00e9j\u00e0 depuis longtemps mais que j\u2019ai d\u00fb m\u2019avouer officiellement r\u00e9cemment, c\u2019est [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[],"tags":[580,1009,582],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2678"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2678"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2678\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2681,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2678\/revisions\/2681"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2678"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2678"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/debutant\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2678"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}