{"id":1143,"date":"2015-08-17T17:08:33","date_gmt":"2015-08-17T16:08:33","guid":{"rendered":"http:\/\/www.blog-lecerveau.org\/?p=4698"},"modified":"2022-01-04T21:10:04","modified_gmt":"2022-01-04T20:10:04","slug":"une-representation-3d-a-lechelle-du-nanometre-du-cortex-de-souris","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/2015\/08\/17\/une-representation-3d-a-lechelle-du-nanometre-du-cortex-de-souris\/","title":{"rendered":"Une repr\u00e9sentation 3D \u00e0 l\u2019\u00e9chelle du nanom\u00e8tre du cortex de souris"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" class=\"alignleft\" title=\"Lichtman2\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/Lichtman2.jpg\" alt=\"\" width=\"200\" height=\"208\" \/>En mai dernier, j\u2019ai fait deux <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2015\/05\/13\/la-complexite-a-pied-quand-le-mont-royal-devient-votre-cerveau\/\"><span style=\"color: #008080;\">randonn\u00e9es p\u00e9destres au mont Royal \u00e0 Montr\u00e9al en pr\u00e9sentant celui-ci comme un mod\u00e8le \u00e0 grande \u00e9chelle de la \u00ab\u00a0for\u00eat de neurones\u00a0\u00bb<\/span><\/a><\/span> que constitue notre cerveau. L\u2019analogie n\u2019\u00e9tait pas nouvelle, mais le fait d\u2019observer les branches des arbres s\u2019entrecroiser comme si c\u2019\u00e9tait des axones et des dendrites donnait une petite \u00ab\u00a0valeur ajout\u00e9e\u00a0\u00bb \u00e0 la m\u00e9taphore. Dans la partie la plus dense de la for\u00eat, on en venait m\u00eame \u00e0 se demander si voir chaque bourgeon qui s\u2019ouvrait comme des \u00e9pines dendritiques recevant autant de connexions des branches qui l\u2019entouraient n\u2019\u00e9tait pas un peu exag\u00e9r\u00e9.<\/p>\n<p>\u00c0 la lumi\u00e8re des derni\u00e8res images produites par l\u2019\u00e9quipe de Jeff Lichtman et Narayanan Kasthuri (voir les deux premiers liens ci-dessous), on serait plut\u00f4t port\u00e9 \u00e0 se trouver un peu na\u00eff tellement la complexit\u00e9 de la connectivit\u00e9 c\u00e9r\u00e9brale d\u00e9passe, et de loin, celle de des arbres d\u2019une for\u00eat, aussi dense soit-elle !<!--more--><\/p>\n<p><span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2014\/09\/15\/des-synapses-microscopiques-et-des-microscopes-gigantesques\/\"><span style=\"color: #008080;\">Lichtman le r\u00e9p\u00e8te depuis longtemps\u00a0<\/span><\/a><\/span>: c\u2019est en allant \u00e0 l\u2019\u00e9chelle de r\u00e9solution du microscope \u00e9lectronique et en reconstituant tranche par tranche les moindres contacts entre les axones, les dendrites et les cellules gliales avoisinantes que nous pourrons voir appara\u00eetre des patterns qui nous \u00e9chappent aux \u00e9chelles plus \u00ab\u00a0macros\u00a0\u00bb utilis\u00e9es jusqu\u2019ici pour construire nos mod\u00e8les de connectivit\u00e9 neuronale.<\/p>\n<p>Il n\u2019y a qu\u2019\u00e0 visionner le court vid\u00e9o de 45 secondes du premier lien ci-bas ou le vid\u00e9o du troisi\u00e8me pour constater d\u2019abord qu\u2019il n\u2019y a pas de \u00ab\u00a0vide\u00a0\u00bb dans cortex c\u00e9r\u00e9bral de souris pr\u00e9sent\u00e9 ici (contrairement \u00e0 l\u2019espace entre les branches de la for\u00eat). Tout l\u2019espace est rempli de ces prolongements cellulaires qui se touchent et s\u2019entrelacent inextricablement. Et c\u2019est l\u00e0 que la reconstitution 3D par ordinateur montre toute sa puissance en pouvant faire appara\u00eetre ou dispara\u00eetre \u00e0 loisir tant\u00f4t seulement certains types d\u2019axones (<span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/i\/i_01\/i_01_cl\/i_01_cl_fon\/i_01_cl_fon.html#2\"><span style=\"color: #008080;\">my\u00e9linis\u00e9s <\/span><\/a><\/span>ou pas, par exemple), tant\u00f4t certains types de dendrites, ou encore certaines <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2014\/07\/28\/la-cote-des-cellules-gliales-en-hausse-celle-des-neurones-miroirs-en-baisse\/\"><span style=\"color: #008080;\">cellules gliales<\/span><\/a><\/span> et pas d\u2019autres (<span style=\"color: #ff0000;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/a\/a_01\/a_01_cl\/a_01_cl_ana\/a_01_cl_ana.html#2\"><span style=\"color: #ff0000;\">astrocytes <\/span><\/a><\/span>ou oligodendrocytes), etc.<\/p>\n<p>Dans l\u2019autre vid\u00e9o d\u2019environ 5 minutes pr\u00e9sentant la technique utilis\u00e9e pour cr\u00e9er ces spectaculaires images en 3D, Lichtman rappelle qu\u2019on a longtemps cru, en vertu de la r\u00e8gle dite \u00ab\u00a0de Peter\u00a0\u00bb (\u00e0 ne pas confondre avec le principe d\u2019incomp\u00e9tence du m\u00eame nom\u2026), que si l\u2019on connaissait suffisamment la position d\u2019un axone et d\u2019un dendrite, on pouvait d\u00e9duire <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"http:\/\/lecerveau.mcgill.ca\/flash\/i\/i_01\/i_01_m\/i_01_m_ana\/i_01_m_ana.html\"><span style=\"color: #008080;\">les zones de contact formant les synapses entre les deux<\/span><\/a><\/span>. Ce n\u2019est malheureusement pas ce que montrent les images qu\u2019ils ont obtenues. Celles-ci r\u00e9v\u00e8lent plut\u00f4t une irr\u00e9gularit\u00e9 que seule une meilleure connaissance des propri\u00e9t\u00e9s mol\u00e9culaires des axones et des \u00e9pines dendritiques permettra d\u2019\u00e9lucider.<\/p>\n<p>Comme souvent en science, on constate donc qu\u2019une avanc\u00e9e importante repousse les questions \u00e0 un niveau d\u2019analyse qui devra \u00eatre encore plus fin. \u00c7a peut sembler d\u00e9courageant, mais comme le dit Lichtman \u00e0 la fin du vid\u00e9o\u00a0: il n\u2019y a jamais eu de cas, en biologie, ou en savoir plus \u00e9tait moins bon qu\u2019en savoir moins. Ou encore, au risque de me r\u00e9p\u00e9ter, cette fameuse pens\u00e9e de Katz et Rosenzweig <span style=\"color: #008080;\"><a href=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/blog\/2015\/06\/03\/des-pericytes-qui-font-le-travail-attribue-aux-astrocytes\/\"><span style=\"color: #008080;\">d\u00e9j\u00e0 cit\u00e9e dans le billet sur le r\u00f4le sous-estim\u00e9 des p\u00e9ricytes<\/span><\/a><\/span>, qui saisit si bien l\u2019essence de la d\u00e9marche scientifique\u00a0:<\/p>\n<p>\u00ab We have not succeeded in answering all our problems\u2014indeed we sometimes feel we have not completely answered any of them.<br \/>\nThe answers we have found have only served to raise a whole set of new questions.<br \/>\nIn some ways we feel that we are as confused as ever, but we think we are confused on a higher level and about more important things.\u201d<\/p>\n<p>Tout ce que je peux donc esp\u00e9rer c\u2019est que la lecture des travaux que je rapporte dans ce blogue vous laisse confus, mais \u00e0 un niveau de confusion un peu plus \u00e9lev\u00e9 et pour des choses un peu plus importantes qu\u2019avant leur lecture\u2026\u00a0 \ud83d\ude09<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/www.theguardian.com\/science\/2015\/jul\/30\/3d-brain-map-reveals-connections-between-cells-in-nano-scale\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> 3D brain map reveals connections between cells in nano-scale <\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.cell.com\/cell\/abstract\/S0092-8674%2815%2900824-7?_returnURL=http%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867415008247%3Fshowall%3Dtrue\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/a_exp.gif\" alt=\"a_exp\" width=\"15\" height=\"15\" \/> <span style=\"color: #ff0000;\">Saturated Reconstruction of a Volume of Neocortex<\/span><\/span><\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/news.sciencemag.org\/brain-behavior\/2015\/07\/detailed-video-mouse-brain-will-make-you-think-twice-about-studying\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"color: #008080;\"><img loading=\"lazy\" style=\"border: 0pt;\" src=\"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/wp-content\/uploads\/i_lien.gif\" alt=\"i_lien\" width=\"15\" height=\"15\" \/> Video: An incredibly detailed tour through the mouse brain<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>En mai dernier, j\u2019ai fait deux randonn\u00e9es p\u00e9destres au mont Royal \u00e0 Montr\u00e9al en pr\u00e9sentant celui-ci comme un mod\u00e8le \u00e0 grande \u00e9chelle de la \u00ab\u00a0for\u00eat de neurones\u00a0\u00bb que constitue notre cerveau. L\u2019analogie n\u2019\u00e9tait pas nouvelle, mais le fait d\u2019observer les branches des arbres s\u2019entrecroiser comme si c\u2019\u00e9tait des axones et des dendrites donnait une petite [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[1],"tags":[609,145,146,520,216],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1143"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1143"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1143\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2312,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1143\/revisions\/2312"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1143"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1143"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blog-lecerveau.org\/avance\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1143"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}